హరప్పన్ల పారిశుధ్య మరియు ప్రజారోగ్య స్పృహకు అత్యుత్తమ నిదర్శనం వారి భూగర్భ మురుగునీటి వ్యవస్థ (Underground Drainage System). ప్రతి ఇంటి స్నానాల గది నుండి మురుగునీరు గోడల గుండా వీధిలోని ప్రధాన కాలువలోకి చేరేది.
ఈ కాలువలను ఇటుకలు లేదా సున్నపురాతి పలకలతో కప్పి ఉంచేవారు. చెత్తను నిరోధించడానికి మ్యాన్హోల్స్ (Sump pits), శుభ్రం చేయడానికి నిర్దిష్ట దూరాల్లో తనిఖీ గుంతలు ఏర్పాటు చేశారు.
ప్రాచీన ప్రపంచంలో మరే నాగరికతలోనూ ఇంతటి ఆధునిక డ్రైనేజీ వ్యవస్థ లేదు.